De verovering van Oaxaca verliep relatief vreedzaam, aangezien de Zapoteken en de Mixteken heren dachten dat ze in de Europeanen de bondgenoten zouden vinden die ze nodig hadden om de Azteken te verslaan.
Aan de andere kant verzetten andere groepen zoals de Zapotecs van de Sierra, de Chontales en vooral de Mixes zich en voerden een vervolg op rebellie uit. Na hun triomf en nog steeds in de 16e eeuw, hebben de Spanjaarden de inboorlingen van hun land ontdaan en deze actie gelegaliseerd door middel van encomiendas, mercedes en divisies die door de koning waren verleend, en aldus, vanaf het begin van de Spaanse verovering, de onbalans en de ongelijkheid die zou heersen tussen de Spaanse en de inheemse samenleving.
Het misbruik door de kolonisatoren was zo overvloedig dat een groot deel van het werk van de twee Audiencias en onderkoning Antonio de Mendoza erop gericht was de macht van de markies van Valle de Oaxaca, Hernán Cortés, en die van de encomenderos te beperken. Ze stelden dus voor om het koninklijk gezag te versterken en daarom werden de nieuwe wetten (1542) afgekondigd en werd een complexe administratie gecreëerd. De taak van de evangelisatie in het Mixteken- en Zapotekengebied was het werk van de Dominicaanse orde die, met in wezen inheems werk, weelderige kerken en kloosters bouwde op de plaatsen waar de grote bevolkingscentra waren geconcentreerd, zoals de stad Antequera, Yanhuitián en Cuilapan. .
De spirituele verovering was radicaler en gewelddadiger dan de militaire verovering. Om de controle over de bevolking te behouden, onderhielden de veroveraars, met aanpassingen, bepaalde inheemse structuren op zo'n manier dat sommige van de leiders van de vallei van Oaxaca en de Mixteca Alta erin slaagden oude privileges en eigendommen te behouden; Om de volkeren van Amerika tot het christendom te bekeren, probeerden de missionarissen in plaats daarvan elk spoor van de religie van de pre-Spaanse wereld te vernietigen.
Ondanks de demografische achteruitgang van de inheemse bevolking, veroorzaakt door epidemieën en mishandeling, was de 16e eeuw er een van economische groei door de introductie van nieuwe technieken, gewassen en soorten. In de Mixteca werden bijvoorbeeld goede winsten behaald met de exploitatie van zijderupsen, vee en tarwe. De ontwikkeling van de stedelijke markt en mijnen droegen bij aan deze groei.
Deze welvaart werd echter onderbroken door de problemen waarmee de mijnbouw sinds 1590 werd geconfronteerd. De handel tussen Sevilla en Amerika nam af en de afname van de bevolking zorgde ervoor dat de consumptie van de steden afnam en het personeelsbestand tot een minimum werd beperkt.
In de zeventiende eeuw was de economische depressie toen ze de koloniale structuren definieerden, het overheersingsschema werd geconsolideerd en de mechanismen van een afhankelijke economie werden ingesteld. De toepassing van een monopolie en een gecentraliseerde commerciële regeling belemmerde de regionale economische ontwikkeling, waardoor gebieden zo rijk als de vallei van Oaxaca hun economie richtten op zelfvoorziening, ondanks het belang van de productie en handel van cacao, indigo en cochenille. .
Al in de tweede helft van de zeventiende eeuw begon de economie van Nieuw-Spanje te verbeteren: de mijnbouwproductie herstelde zich, de handel met Midden-Amerika en Peru werd weer toegestaan en de inheemse bevolking begon zich te herstellen. Tegen die tijd wijdden de Spanjaarden die in de Mixteca en in de vallei van Oaxaca woonden zich in grote hoeveelheden aan veeteelt en de haciënda's combineerden met succes de productie van tarwe en maïs met het fokken van vee. De koloniale economie werd tussen 1660 en 1692 geherstructureerd, waarmee de basis werd gelegd voor de eeuw van de Verlichting.
Nieuw Spanje groeit en bloeit in het tijdperk van de Verlichting. Het grondgebied verdubbelt, de bevolking verdrievoudigt en de waarde van de economische productie verzesvoudigd. Het beste voorbeeld van deze vooruitgang wordt waargenomen in de mijnbouw, een centrale economische as die, hoewel hij nog steeds tot slaaf was gemaakt, van 3.300.000 peso's in 1670 naar 27.000.000 in 1804 ging.
De weelde van Nieuw-Spanje komt tot uiting in de intense bouwactiviteit en overstroomt in de pracht van de barok, het was toen dat ze in Antequera onder andere de kapel van de rozenkrans van de kerk van Santo Domingo, de kerk van de Soledad, San Agustín en Consolación.
De 18e eeuw was de eeuw waarin de politieke en economische hervormingen van de Bourbon-koningen werden gemoderniseerd.
Tegen 1800 was Mexico een land van buitengewone rijkdom maar ook van extreme armoede geworden, de meerderheid van de bevolking was gehecht aan de haciënda's en communes, ze werden mishandeld op de werkplekken, werden tot slaaf gemaakt in de mijnen en molens, zonder vrijheid, zonder geld. en zonder enige mogelijkheid om te verbeteren.
De schiereiland-Spanjaarden monopoliseerden de politieke en economische macht; Dergelijke omstandigheden van sociale, economische en politieke ongelijkheid leidden tot spanningen en onvrede. Aan de andere kant schudt de impact van gebeurtenissen als de Franse Revolutie, de onafhankelijkheid van de Verenigde Staten en de Engelse Industriële Revolutie het Amerikaanse geweten en begint het idee van de Onafhankelijkheid van Nieuw-Spanje vorm te krijgen in de Creolen.
